RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 RRM1P23921 792 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ANXA13P27216 316 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 RAP1GAPP47736 663 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CAP1Q01518 475 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GRIK4Q16099 956 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TAF4BQ92750 862 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 KAT2BQ92831 832 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 NUP85Q9BW27 656 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 AMFRQ9UKV5 643 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 POLIQ9UNA4 740 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TLDC2A0PJX2 215 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 LACTBL1A8MY62 500 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GZMAP12544 262 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 COMTP21964 271 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CASP8Q14790 479 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 WDR93Q6P2C0 686 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 KCNN1Q92952 543 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 SIX4Q9UIU6 781 aa6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 NCANO14594 1321 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 H3BQF6 201 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 MAP2K7O14733 419 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 RAD51CO43502 376 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 FGGP02679 453 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 STAG3L1P0CL83 205 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 MAPK4P31152 587 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ADCY1Q08828 1119 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CCDC25Q86WR0 208 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 AMACRQ9UHK6 382 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 UNCXA6NJT0 531 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GNA15P30679 374 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GUCY2DQ02846 1103 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 MAP2K5Q13163 448 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 MORN1Q5T089 497 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 C8orf74Q6P047 294 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 SESTD1Q86VW0 696 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 OSMRQ99650 979 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 FAM153BP0C7A2 387 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 SCP2P22307 547 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CRHR2Q13324 411 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TFDP1Q14186 410 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 DGKDQ16760 1214 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 FAM153CQ494X1 144 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 JADE1Q6IE81 842 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 KRT222Q8N1A0 295 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TFAP2BQ92481 460 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 CISHQ9NSE2 258 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.05□□□□□ -1.44
USP15-201ENST00000280377 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms