RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265616.9

UBXN8-201, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN8, Length 1,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-201ENST00000265616 PRELID2Q8N945 189 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CHMP6Q96FZ7 201 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 NT5C1BQ96P26 610 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 SERPINB12Q96P63 405 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ZHX2Q9Y6X8 837 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 WDR81Q562E7 1941 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 LOC285556D6RIA3 1793 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PCNTO95613 3336 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 NFASCO94856 1347 aa8.33□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 E7EVH7 732 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ADH1AP07327 375 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ARP10275 920 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ATP1A2P50993 1020 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PDE6CP51160 858 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 SLC18A1P54219 525 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 JAG1P78504 1218 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 RELBQ01201 579 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CALCOCO2Q13137 446 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 RASA2Q15283 850 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ODF2Q5BJF6 829 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 KCTD16Q68DU8 428 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 GJB7Q6PEY0 223 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PARD3BQ8TEW8 1205 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ALG3Q92685 438 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 33.2
UBXN8-201ENST00000265616 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 HOOK2Q96ED9 719 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PGAP2Q9UHJ9 254 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 COG5Q9UP83 839 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 A0A1B0GUA9 196 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 FAM196BA6NMK8 535 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 O00370 1275 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 THAP12O43422 761 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PSTPIP1O43586 416 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ECEL1O95672 775 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 GAS8O95995 478 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PIGRP01833 764 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ABHD2P08910 425 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TRIM49P0CI25 452 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TRIM49CP0CI26 452 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 BMP2P12643 396 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CHRNB2P17787 502 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 COMTP21964 271 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 AP3M2P53677 418 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CACNB3P54284 484 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PPP3CAQ08209 521 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 USP4Q13107 963 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 XRCC4Q13426 336 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 MTMR1Q13613 665 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TNFAIP1Q13829 316 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PTK6Q13882 451 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 HELQQ8TDG4 1101 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 RAPGEF5Q92565 580 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.32□□□□□ -1.08
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms