RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 K7ERI5 159 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 DSG3P32926 999 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 WNT7BP56706 349 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 IL9RQ01113 521 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 GAD2Q05329 585 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 VSTM1Q6UX27 236 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 FEM1BQ9UK73 627 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.21□□□□□ -0.13
TMOD1-201ENST00000259365 ENTPD3O75355 529 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GZMAP12544 262 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ATP5DP30049 168 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GPD1LQ8N335 351 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CALN1Q9BXU9 219 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RNF146Q9NTX7 359 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 UVRAGQ9P2Y5 699 aa14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SSTR1P30872 391 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 COPS2P61201 443 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CYP24A1Q07973 514 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FBF1Q8TES7 1133 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SEC14L1Q92503 715 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SMC6Q96SB8 1091 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 TRABDQ9H4I3 376 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZBED4O75132 1171 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FOXN2P32314 431 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PCK1P35558 622 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 NCALDP61601 193 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SLC15A2Q16348 729 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 EMC1Q8N766 993 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 IWS1Q96ST2 819 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GINM1Q9NU53 330 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GUA9 196 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ASAP2O43150 1006 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 NR3C2P08235 984 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ASNSP08243 561 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■□ 20.1
TMOD1-201ENST00000259365 CDO1Q16878 200 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FAM160B2Q86V87 743 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC89Q8N998 374 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF516Q92618 1163 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FBXO40Q9UH90 709 aa14.2□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GTF2H1P32780 548 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CLUL1Q15846 466 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 FAM151AQ8WW52 585 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 HSPH1Q92598 858 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF862O60290 1169 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 GRAP2O75791 330 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 EGFRP00533 1210 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 CYP1A2P05177 515 aa14.19□□□□□ -0.14
TMOD1-201ENST00000259365 ICAM1P05362 532 aa14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms