RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PADI6Q6TGC4 694 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF365Q70YC5 407 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 KAT5Q92993 513 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 UNC45AQ9H3U1 944 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 STAT2P52630 851 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 GTF2BQ00403 316 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 KRT39Q6A163 491 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TRABD2AQ86V40 505 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP120Q8N960 986 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZFATQ9P243 1243 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TBC1D12O60347 775 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR2MP0CAP2 368 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CETPP11597 493 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PLS3P13797 630 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TGFB2P61812 414 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PDK4Q16654 411 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM83AQ86UY5 434 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CDAN1Q8IWY9 1227 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF398Q8TD17 642 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXO41Q8TF61 875 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ERP27Q96DN0 273 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 NDC80O14777 642 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ENPEPQ07075 957 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 LMNTD2Q8IXW0 634 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CHKBQ9Y259 395 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PSTPIP1O43586 416 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 GRIN3BO60391 1043 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PEX11AO75192 247 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 GTF2H1P32780 548 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF677Q86XU0 584 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 HELQQ8TDG4 1101 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 NT5C1BQ96P26 610 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TBK1Q9UHD2 729 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP6V1C1P21283 382 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 IZUMO3Q5VZ72 239 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.476e-7■■■■■ 139.2
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TLE6Q9H808 572 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM170AA1A519 330 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBTB7AO95365 584 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TPBGLP0DKB5 382 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGEA4P43358 317 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 USP37Q86T82 979 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SAR1AQ9NR31 198 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 RRM1P23921 792 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ABL2P42684 1182 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 NSMFQ6X4W1 530 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM13CQ8NE31 585 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ACADSP16219 412 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TMED2Q15363 201 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.474e-6■■■■□ 20
ANKRD54-201ENST00000215941 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOC7Q9UPT5 735 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 WNT10BO00744 389 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 UNGP13051 313 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 KLRC2P26717 231 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 CAP2P40123 477 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 LBRQ14739 615 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM47EQ6ZV65 393 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TMC2Q8TDI7 906 aa24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms