RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612286.4

HOXA3-207, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA3, Length 3,396 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-207ENST00000612286 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 SCARA3Q6AZY7 606 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 TTC7BQ86TV6 843 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 FAM20AQ96MK3 541 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 WNT8AQ9H1J5 351 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 E2F8A0AVK6 867 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 KRT36O76013 467 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 ALAS1P13196 640 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 RCN1Q15293 331 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 TMEM270Q6UE05 265 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 MAML1Q92585 1016 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 P3H4Q92791 437 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 ZWILCHQ9H900 591 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 GINM1Q9NU53 330 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 UNC5CO95185 931 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 GSTA1P08263 222 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 SREBF1P36956 1147 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 LRRC6Q86X45 466 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 NT5C1BQ96P26 610 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXA3-207ENST00000612286 LRRD1A4D1F6 860 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 DCCP43146 1447 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SMARCA1P28370 1054 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 PPP2R5EQ16537 467 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 CEP55Q53EZ4 464 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TSC22D3Q99576 134 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TTC1Q99614 292 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 NENFQ9UMX5 172 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 DENND3A2RUS2 1198 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 CDH16O75309 829 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 FGFR1P11362 822 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 CETN2P41208 172 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 MFAP3P55082 362 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SATB1Q01826 763 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 KIF22Q14807 665 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 LMO3Q8TAP4 145 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ZFATQ9P243 1243 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ATP5DP30049 168 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ALDH3A1P30838 453 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 STAT2P52630 851 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 KDSRQ06136 332 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 AP3B2Q13367 1082 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ALCAMQ13740 583 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 UGCGQ16739 394 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 FIZ1Q96SL8 496 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SYT15Q9BQS2 421 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 PLVAPQ9BX97 442 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TP73O15350 636 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 KRT1P04264 644 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 LINGO3P0C6S8 592 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SERPINB12Q96P63 405 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 DCLK3Q9C098 648 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXA3-207ENST00000612286 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms