RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591956.1

SNHG16-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

TSL 2

Gene SNHG16, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-208	ENST00000591956	HYAL1	Q12794	435 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	HPS3	Q969F9	1004 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	DMAC2	Q9NW81	257 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	DPP7	Q9UHL4	492 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ANO9	A1A5B4	782 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PIR	O00625	290 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	MAPK13	O15264	365 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PAPLN	O95428	1278 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PPP1R2	P41236	205 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PTPN14	Q15678	1187 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	SEZ6	Q53EL9	994 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	BEST2	Q8NFU1	509 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	KIF12	Q96FN5	646 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ANK1	P16157	1881 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	HIDE1	A8MVS5	230 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	TISP43	B9A030	160 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PODXL	O00592	558 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	SYN3	O14994	580 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	UROD	P06132	367 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	FGFR3	P22607	806 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	LTBR	P36941	435 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	GLUD2	P49448	558 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43	6e-7	■□□□□ 9.5
SNHG16-208	ENST00000591956	CLDN10	P78369	228 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	GBP4	Q96PP9	640 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNHG16-208	ENST00000591956		M0QZQ0	153 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	KIF4A	O95239	1232 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	NRIP1	P48552	1158 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	PNOC	Q13519	176 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	JADE1	Q6IE81	842 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	CENPP	Q6IPU0	288 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	SMARCE1	Q969G3	411 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SNHG16-208	ENST00000591956	IKBKB	O14920	756 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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