RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563830.2

SNAP23-208, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5

Gene SNAP23, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-208	ENST00000563830	ARFIP2	P53365	341 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KRT72	Q14CN4	511 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF124	Q15973	351 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	HS1BP3	Q53T59	392 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF365	Q70YC5	407 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	IL31RA	Q8NI17	732 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	SCAMP4	Q969E2	229 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PGBD4	Q96DM1	585 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM89A	Q96GI7	184 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	MYD88	Q99836	296 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	NDC1	Q9BTX1	674 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	DPH1	Q9BZG8	443 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	APAF1	O14727	1248 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GRM6	O15303	877 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PMM2	O15305	246 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GNAI2	P04899	355 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	TCF15	Q12870	199 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	LLGL1	Q15334	1064 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	APOA5	Q6Q788	366 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	REPS2	Q8NFH8	660 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	CEP95	Q96GE4	821 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	BRD9	Q9H8M2	597 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GPR35	Q9HC97	309 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SNAP23-208	ENST00000563830	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	RARB	P10826	455 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC5A1	P13866	664 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	FPR1	P21462	350 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	CNGA2	Q16280	664 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	CCDC93	Q567U6	631 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	UBXN11	Q5T124	520 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	FITM2	Q8N6M3	262 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	MORC4	Q8TE76	937 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	TFAP2C	Q92754	450 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	RSAD1	Q9HA92	442 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	SERHL	Q9NQF3	203 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF536	O15090	1300 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	PATE3	B3GLJ2	98 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	CYP2C9	P11712	490 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ZNF529	Q6P280	563 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	SMC5	Q8IY18	1101 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	EDA	Q92838	391 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	PMM1	Q92871	262 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	LDAH	Q9H6V9	325 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SNAP23-208	ENST00000563830	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42

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