RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	FSCN2	O14926	492 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIF4A	O95239	1232 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CXCL14	O95715	111 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TNNC2	P02585	160 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	NR3C1	P04150	777 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PTMS	P20962	102 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRPAP1	P30533	357 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MCM4	P33991	863 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ERVFC1	P60507	584 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TLE6	Q9H808	572 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.01	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	BIN1	O00499	593 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	NFIC	P08651	508 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TNNI1	P19237	187 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	NR2F2	P24468	414 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	IRS1	P35568	1242 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRCP	P42785	496 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CAMK1	Q14012	370 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZBTB6	Q15916	424 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	NFIL3	Q16649	462 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CEP57	Q86XR8	500 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DPP3	Q9NY33	737 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	COG5	Q9UP83	839 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYO7A	Q13402	2215 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SZT2	Q5T011	3432 aa		13	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANK1	P16157	1881 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	BICDL2	A1A5D9	508 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	C2CD2L	O14523	706 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CETN3	O15182	167 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRT13	P13646	458 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PNPLA4	P41247	253 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	NRIP1	P48552	1158 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DSG1	Q02413	1049 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRRC63	Q05C16	580 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADAM9	Q13443	819 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PSMD6	Q15008	389 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	WDR49	Q8IV35	697 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518		F8W810	466 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518		H7C4K7	107 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SYN3	O14994	580 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAPK13	O15264	365 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADH1A	P07327	375 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRT19	P08727	400 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	KLRC2	P26717	231 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TAF6	P49848	677 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	AP3M2	P53677	418 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CYP24A1	Q07973	514 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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