RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546120.2

UBC-213, Transcript of ubiquitin C, human

TSL 5 BASIC

Gene UBC, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBC-213	ENST00000546120	CYP1A2	P05177	515 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FAM163B	P0C2L3	166 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MYL4	P12829	197 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TXK	P42681	527 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GJA8	P48165	433 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NR1H2	P55055	460 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NUP107	P57740	925 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	RTP1	P59025	263 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GPSM2	P81274	684 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ENPEP	Q07075	957 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CBX3	Q13185	183 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CBLB	Q13191	982 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PARP10	Q53GL7	1025 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SGO2	Q562F6	1265 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DYM	Q7RTS9	669 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PDSS2	Q86YH6	399 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	AHI1	Q8N157	1196 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TTC8	Q8TAM2	541 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SGF29	Q96ES7	293 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	AGPAT1	Q99943	283 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SIX2	Q9NPC8	291 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KCND2	Q9NZV8	630 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GCNT4	Q9P109	453 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	RAB26	Q9ULW5	256 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	USP17L21	D6R901	530 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120		E9PBE3	544 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TYROBP	O43914	113 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MARCH6	O60337	910 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	OPHN1	O60890	802 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SPAG6	O75602	509 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ACSL3	O95573	720 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CLPTM1	O96005	669 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PLA2G4B	P0C869	781 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZNF12	P17014	697 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SLC9A1	P19634	815 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CA4	P22748	312 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SERPINB3	P29508	390 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ADCY8	P40145	1251 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MAGEA4	P43358	317 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	USP46	P62068	366 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KRT17	Q04695	432 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZBTB17	Q13105	803 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DNAJC3	Q13217	504 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ALCAM	Q13740	583 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MPP2	Q14168	576 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MORF4L2	Q15014	288 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	KRT39	Q6A163	491 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TMEM110	Q86TL2	294 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	BBS5	Q8N3I7	341 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	NRG4	Q8WWG1	115 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	ALG3	Q92685	438 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SLC35C1	Q96A29	364 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	SKA1	Q96BD8	255 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PLIN2	Q99541	437 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	WWP1	Q9H0M0	922 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		10.76	□□□□□ -0.69
UBC-213	ENST00000546120	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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