RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ACTN3-202ENST00000511191 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 RB1P06400 928 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TNNI1P19237 187 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 GTF2H1P32780 548 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PPM1AP35813 382 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 DLG4P78352 724 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 UPP1Q16831 310 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CXorf38Q8TB03 319 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF516Q92618 1163 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 DPP3Q9NY33 737 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ANO9A1A5B4 782 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 NRP1O14786 923 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 STX10O60499 249 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TNNC2P02585 160 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SLC35C1Q96A29 364 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.88■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SMTNL1A8MU46 457 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PODXLO00592 558 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PIRO00625 290 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 OR1G1P47890 313 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CLCNKBP51801 687 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 GUCY2FP51841 1108 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 IQCB1Q15051 598 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 EPC2Q52LR7 807 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 IGSF21Q96ID5 467 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TSPY26PQ9H489 355 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 MARCH5Q9NX47 278 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SPG21Q9NZD8 308 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM49P0CI25 452 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM49CP0CI26 452 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PAX3P23760 479 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CTNNB1P35222 781 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PLCB3Q01970 1234 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ZACNQ401N2 412 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CBX8Q9HC52 389 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 FANCLQ9NW38 375 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SIX4Q9UIU6 781 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PMM2O15305 246 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 EFEMP2O95967 443 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF18P17022 549 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PBX3P40426 434 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 PPP3CAQ08209 521 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SV2AQ7L0J3 742 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 SPRED2Q7Z698 418 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 FAM84AQ96KN4 292 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 KCNJ18B7U540 433 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 KIF4AO95239 1232 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 ITGB3P05106 788 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 RBP5P82980 135 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 KCNJ12Q14500 433 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TCP11X2Q5H9J9 407 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 KRT39Q6A163 491 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 GPR153Q6NV75 609 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.84■■□□□ 1.25
ACTN3-202ENST00000511191 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms