RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CYP1A2P05177 515 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GJB1P08034 283 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CLTAP09496 248 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MYBL2P10244 700 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 INSRRP14616 1297 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MAPK4P31152 587 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PSMC4P43686 418 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CLCN3P51790 818 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TNNC1P63316 161 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CUL2Q13617 745 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB33Q86T24 672 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MAML3Q96JK9 1138 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.79□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEB2O15479 319 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PPFIA4O75335 1185 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FCGRTP55899 365 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SLC7A5Q01650 507 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 NCOA4Q13772 614 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DPP9Q86TI2 863 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 AFG1LQ8WV93 481 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP4Q96MN2 994 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CARD9Q9H257 536 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ALG6Q9Y672 507 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TRIP11Q15643 1979 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FAM170AA1A519 330 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC188H7C350 402 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 FAM187BQ17R55 369 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF653Q96CK0 615 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 KRT12Q99456 494 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TINF2Q9BSI4 451 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 GDF3Q9NR23 364 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.78□□□□□ -1
PDE4D-208ENST00000502484 B4GALT5O43286 388 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PHACTR2O75167 634 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ASS1P00966 412 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 HOXC6P09630 235 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CTGFP29279 349 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PHKA2P46019 1235 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 IGBP1P78318 339 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF6Q15052 776 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 UBR7Q8N806 425 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NUP85Q9BW27 656 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ST7Q9NRC1 585 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 H3BRB1 525 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 B4GALT4O60513 344 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GLI1P08151 1106 aa8.77□□□□□ -1.01
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