RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 ABCF2Q9UG63 623 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 VSTM5A8MXK1 200 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 F2RL2O00254 374 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 ITGB1P05556 798 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 ADRB1P08588 477 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 MYBP10242 640 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC6A4P31645 630 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 IL12RB1P42701 662 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 PTTG1IPP53801 180 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 NRN1LQ496H8 165 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 RABL3Q5HYI8 236 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 GPR20Q99678 358 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 H3BUI4 141 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 TRIM24O15164 1050 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 SLC43A1O75387 559 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 RECQL4O94761 1208 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 UBXN7O94888 489 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 HAUS5O94927 633 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 TYRP14679 529 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 METRNLQ641Q3 311 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 FITM2Q8N6M3 262 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 WDCPQ9H6R7 721 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 PNPOQ9NVS9 261 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 JKAMPQ9P055 326 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 CEP72Q9P209 647 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRK-215ENST00000498284 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRK-215ENST00000498284 PRDX5P30044 214 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 PLS1Q14651 629 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRK-215ENST00000498284 C8orf48Q96LL4 319 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 NEU1Q99519 415 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 ARMT1Q9H993 441 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRK-215ENST00000498284 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF185O15231 689 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRK-215ENST00000498284 PRSS23O95084 383 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 CKBP12277 381 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRK-215ENST00000498284 CCDC93Q567U6 631 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF365Q70YC5 407 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRK-215ENST00000498284 SPRED1Q7Z699 444 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 DAAM2Q86T65 1068 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-215ENST00000498284 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.63□□□□□ -1.51
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