RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 LAG3P18627 525 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 PBX3P40426 434 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SLC11A1P49279 550 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 BCAR1P56945 870 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 PPP3CAQ08209 521 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 C1orf127Q8N9H9 656 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 TSPY26PQ9H489 355 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 FANCLQ9NW38 375 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-210ENST00000477812 ANO9A1A5B4 782 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 UPP1Q16831 310 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 DUOXA2Q1HG44 320 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 BEST2Q8NFU1 509 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TIFAQ96CG3 184 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 UROC1Q96N76 676 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 MARCH5Q9NX47 278 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SIX4Q9UIU6 781 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 F8W810 466 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 NRP1O14786 923 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TNNI1P19237 187 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CLCNKBP51801 687 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ERVK-21P61565 698 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 USP37Q86T82 979 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 RABGGTAQ92696 567 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ZNF558Q96NG5 402 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 DPP3Q9NY33 737 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PIRO00625 290 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PPEF2O14830 753 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 KIF4AO95239 1232 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 EFEMP2O95967 443 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 GTF2H1P32780 548 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 BMPR1AP36894 532 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 AP3M2P53677 418 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ZACNQ401N2 412 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SV2AQ7L0J3 742 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 LUZP1Q86V48 1076 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 KCNJ18B7U540 433 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PODXLO00592 558 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ITGB1P05556 798 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 OR1G1P47890 313 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 KCNJ12Q14500 433 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PLVAPQ9BX97 442 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 VNN1O95497 513 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 TNNC2P02585 160 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ALDH2P05091 517 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 ITGB3P05106 788 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CTNNB1P35222 781 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 GCLMP48507 274 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CBWD6Q4V339 395 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 EPC2Q52LR7 807 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 IGSF21Q96ID5 467 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SAMD11Q96NU1 681 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-210ENST00000477812 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms