RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475553.1

USP37-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 37, human

TSL 4

Gene USP37, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP37-208	ENST00000475553	PNPO	Q9NVS9	261 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		6.99	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	PLIN1	O60240	522 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	TUSC2	O75896	110 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	AMH	P03971	560 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	MYL1	P05976	194 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CD1A	P06126	327 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	GNAI3	P08754	354 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	HK1	P19367	917 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CTSW	P56202	376 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	GNAI1	P63096	354 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	SNAPC2	Q13487	334 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	TIFA	Q96CG3	184 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	SLC35A4	Q96G79	324 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	6.98	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CAPN8	A6NHC0	703 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553		K7ESM1	405 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	GRM6	O15303	877 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CACNB3	P54284	484 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	ADAMTS12	P58397	1594 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	GPSM2	P81274	684 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	CRHR2	Q13324	411 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	FGL2	Q14314	439 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	ANKS6	Q68DC2	871 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	MYOC	Q99972	504 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	KCNH6	Q9H252	994 aa		6.97	□□□□□ -1.29
USP37-208	ENST00000475553	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	PATE3	B3GLJ2	98 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	TYR	P14679	529 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	METTL24	Q5JXM2	366 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	DACT2	Q5SW24	774 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	NPNT	Q6UXI9	565 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	CPA4	Q9UI42	421 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	SHROOM2	Q13796	1616 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	RAB1A	P62820	205 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	FAM193A	P78312	1265 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	PLS1	Q14651	629 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553		Q8TCH9	128 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	PGBD4	Q96DM1	585 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	ADO	Q96SZ5	270 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	GPR87	Q9BY21	358 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.95	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553		A0A088AWK7	358 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553		A0A1W2PPL8	197 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	CFAP69	A5D8W1	941 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	F2RL2	O00254	374 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	TPP1	O14773	563 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	MGEA5	O60502	916 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	HAUS5	O94927	633 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	ZBED1	O96006	694 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	PIK3CG	P48736	1102 aa		6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
USP37-208	ENST00000475553	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3

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