RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456953.5

SNHG17-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 17, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG17, Length 546 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG17-208	ENST00000456953	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	CEP68	Q76N32	757 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	NEK8	Q86SG6	692 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	SNTG2	Q9NY99	539 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SNHG17-208	ENST00000456953	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	WDR27	A2RRH5	827 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ZNF263	O14978	683 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	N4BP3	O15049	544 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ABLIM3	O94929	683 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	DEXI	O95424	95 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CCNE1	P24864	410 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	HOXA6	P31267	233 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ROR1	Q01973	937 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	FAM187B	Q17R55	369 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	KCNB2	Q92953	911 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	UROC1	Q96N76	676 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	FZD8	Q9H461	694 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ARNTL	O00327	626 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ATF2	P15336	505 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	RPS6KB1	P23443	525 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	HSPA4	P34932	840 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	VIPR2	P41587	438 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CCR2	P41597	374 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	RARRES1	P49788	294 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CLCNKB	P51801	687 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	LOXL4	Q96JB6	756 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	AKAP13	Q12802	2813 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ZNF806	P0C7X5	589 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ACAP1	Q15027	740 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	UPP1	Q16831	310 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	STPG1	Q5TH74	334 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	POTED	Q86YR6	584 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ELMOD1	Q8N336	334 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	LEMD2	Q8NC56	503 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	E2F7	Q96AV8	911 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ITPR1	Q14643	2758 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953		I3L4J1	428 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	CPLX1	O14810	134 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	AXIN1	O15169	862 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	KCNK5	O95279	499 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	MAPK6	Q16659	721 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	TPGS2	Q68CL5	300 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	IQCE	Q6IPM2	695 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953		Q6ZS52	159 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	AIFM3	Q96NN9	605 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	GPR88	Q9GZN0	384 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SNHG17-208	ENST00000456953	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		14.49	□□□□□ -0.09

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