RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GJA8P48165 433 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 INF2Q27J81 1249 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP7D3Q8IWC1 876 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNE4Q8N205 404 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LCORLQ8N3X6 602 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF653Q96CK0 615 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 OLFM3Q96PB7 478 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ABCB11O95342 1321 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFZP0C0S5 128 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP11B2P19099 503 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5DP30049 168 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 EPS15P42566 896 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GALK1P51570 392 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS8P62241 208 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFVQ71UI9 128 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 BLIDQ8IZY5 108 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 BCS1LQ9Y276 419 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 EXOC3O60645 756 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGIRP43119 386 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF132P52740 706 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 AMPD3Q01432 767 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC63Q05C16 580 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SATL1Q86VE3 508 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 HELQQ8TDG4 1101 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB12Q96P63 405 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TSG101Q99816 390 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TLE6Q9H808 572 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3GLB1Q9Y371 365 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF711Q9Y462 761 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 POTEJP0CG39 1038 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IL9RQ01113 521 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TROAPQ12815 778 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MOGSQ13724 837 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SMYD1Q8NB12 490 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FLCNQ8NFG4 579 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CATSPER2Q96P56 530 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNCQ9H7C4 482 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CNNM1Q9NRU3 951 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SIPA1L1O43166 1804 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MYMKA6NI61 221 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG7O75391 227 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIA2P42262 883 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNDQ07001 517 aa8.9□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R5EQ16537 467 aa8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms