RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	JADE1	Q6IE81	842 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SV2B	Q7L1I2	683 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	PALB2	Q86YC2	1186 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KCNN1	Q92952	543 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ACAP3	Q96P50	834 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.15	□□□□□ -0.62
HDLBP-216	ENST00000428482		A0A0B4J269	797 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482		A0A1B0GVL5	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	SPTLC1	O15269	473 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	OGT	O15294	1046 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CLDN3	O15551	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TADA2A	O75478	443 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	B3GAT3	O94766	335 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	GLUD1	P00367	558 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	AFM	P43652	599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	NTHL1	P78549	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PANK4	Q9NVE7	773 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	NCK2	O43639	380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	KLRC4	O43908	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ASGR2	P07307	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ADH1A	P07327	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ADRB2	P07550	413 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	FGFR3	P22607	806 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	EHHADH	Q08426	723 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	RNF135	Q8IUD6	432 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	MYO10	Q9HD67	2058 aa		11.13	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CCL16	O15467	120 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	HCRT	O43612	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	VNN2	O95498	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	CLTA	P09496	248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	GAP43	P17677	238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	NDUFA8	P51970	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	UBE2H	P62256	183 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ROR1	Q01973	937 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		11.12	□□□□□ -0.63
HDLBP-216	ENST00000428482	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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