RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 XDHP47989 1333 aa5.42□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 CDHR4A6H8M9 788 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 B3GALT2O43825 422 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 ARIH2O95376 493 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 ALAS1P13196 640 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TYRP14679 529 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 ACRV1P26436 265 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SLC6A4P31645 630 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 NHLH2Q02577 135 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 HTR3DQ70Z44 454 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 DAAM2Q86T65 1068 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 EXTL1Q92935 676 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TIFAQ96CG3 184 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PNPOQ9NVS9 261 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 STAP2Q9UGK3 403 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.41□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 A6NNZ2 444 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TUSC2O75896 110 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PRSS23O95084 383 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PRDX5P30044 214 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 IL12RB1P42701 662 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 RAB1AP62820 205 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PLS1Q14651 629 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 CDSNQ15517 529 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SPATS1Q496A3 300 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 NPNTQ6UXI9 565 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 WDCPQ9H6R7 721 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.4□□□□□ -1.54
RBM39-211ENST00000426951 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PLSCR1O15162 318 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM20BO75063 409 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 HAUS5O94927 633 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PHKA1P46020 1223 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GBX1Q14549 363 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ANO6Q4KMQ2 910 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CCDC93Q567U6 631 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 DGKHQ86XP1 1220 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 CCDC136Q96JN2 1154 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM167AQ96KS9 214 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 NT5C1BQ96P26 610 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 NEU1Q99519 415 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 A0A088AWK7 358 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 FAM227AF5H4B4 570 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 KIF3BO15066 747 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 ZNF185O15231 689 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 SLC43A1O75387 559 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AGFG2O95081 481 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 AHSGP02765 367 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GNAI3P08754 354 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 PIK3CGP48736 1102 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 USP14P54578 494 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 GNAI1P63096 354 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 NOMO3P69849 1222 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 NRN1LQ496H8 165 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-211ENST00000426951 RABL3Q5HYI8 236 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms