RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 TRPA1O75762 1119 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2B6P20813 491 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GRAMD1BQ3KR37 738 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DRC3Q9H069 523 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SENP1Q9P0U3 644 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFATQ9P243 1243 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 VGLL3A8MV65 326 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM24O75264 130 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CASP7P55210 303 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT80Q6KB66 452 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GJB7Q6PEY0 223 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBBXA8MT70 800 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIK1P39086 918 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 NTRK3Q16288 839 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 MED15Q96RN5 788 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CD4P01730 458 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 WEE2P0C1S8 567 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 BTBD6Q96KE9 485 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DIAPH2O60879 1101 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SREBF1P36956 1147 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF235Q14590 738 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 VEPH1Q14D04 833 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL15Q16663 113 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RAET1EQ8TD07 263 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PGBD4Q96DM1 585 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 EHD4Q9H223 541 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 THEGQ9P2T0 379 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PXDNQ92626 1479 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2C9P11712 490 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GUCY1A3Q02108 690 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PPME1Q9Y570 386 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 NNMTP40261 264 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEA9P43362 315 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF677Q86XU0 584 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RSPH10BP0C881 870 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC43Q8N309 656 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 APRTP07741 180 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX19P40855 299 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SCOCQ9UIL1 159 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 E5RI56 91 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 ESRRGP62508 458 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 EPC2Q52LR7 807 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GIPC2Q8TF65 315 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 HACD3Q9P035 362 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 H0Y3Z8 333 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 MGEA5O60502 916 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 AGTP01019 485 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT33BQ14525 404 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GMCL1Q96IK5 515 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DCCP43146 1447 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC138Q96M89 665 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 TRABDQ9H4I3 376 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 CETPP11597 493 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2H1P32780 548 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 JAMLQ86YT9 394 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 C9orf72Q96LT7 481 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD51CO43502 376 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 GRAP2O75791 330 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 DPYSL4O14531 572 aa22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms