RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SETD4Q9NVD3 440 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 RAB20Q9NX57 234 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRFP10586 1907 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CTAGE9A4FU28 777 aa7.15□□□□□ -1.26
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HDAC8-211ENST00000415409 TACC1O75410 805 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ERLIN2O94905 339 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 IL18RAPO95256 599 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 VTNP04004 478 aa7.15□□□□□ -1.26
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HDAC8-211ENST00000415409 RARBP10826 455 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MCF2P10911 925 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CYP2C9P11712 490 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CYBAP13498 195 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PROZP22891 400 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CTGFP29279 349 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP25P42331 645 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PIK3CAP42336 1068 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 RGS19P49795 217 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GJA9P57773 515 aa7.15□□□□□ -1.26
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HDAC8-211ENST00000415409 PTK2Q05397 1052 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PRKCZQ05513 592 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 NNTQ13423 1086 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TUBB2AQ13885 445 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGEF6Q15052 776 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZACNQ401N2 412 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 WDR49Q8IV35 697 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 C7orf31Q8N865 590 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 LMBR1Q8WVP7 490 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TSC1Q92574 1164 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 KAT2BQ92831 832 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 HAPLN2Q9GZV7 340 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PDE11AQ9HCR9 933 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 GABRQQ9UN88 632 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.15□□□□□ -1.26
HDAC8-211ENST00000415409 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 ABLIM1O14639 778 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF263O14978 683 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 PJA2O43164 708 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 SEPT4O43236 478 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 B4GALT5O43286 388 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 CLSTN1O94985 981 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D8O95759 1140 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GNRH1P01148 92 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-DRAP01903 254 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TNNC2P02585 160 aa7.14□□□□□ -1.27
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HDAC8-211ENST00000415409 CLTAP09496 248 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 TNFAIP3P21580 790 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 USP8P40818 1118 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 BEX3Q00994 111 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GCNT1Q02742 428 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 AGERQ15109 404 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 NAB2Q15742 525 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC8-211ENST00000415409 GNASQ5JWF2 1037 aa7.14□□□□□ -1.27
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