RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.46■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 INSL6Q9Y581 213 aa25.46■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.46■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 TLL1O43897 1013 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 TPM4P67936 248 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 TUSC3Q13454 348 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CBWD6Q4V339 395 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CBWD3Q5JTY5 395 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CBWD5Q5RIA9 395 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 SV2AQ7L0J3 742 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CXorf38Q8TB03 319 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 PAAF1Q9BRP4 392 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 CWH43Q9H720 699 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 DPP3Q9NY33 737 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 DNAJB4Q9UDY4 337 aa25.45■■□□□ 1.67
PDSS1-201ENST00000376215 LCHNA4D1U4 455 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 CASTOR2A6NHX0 329 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 CYP3A5P20815 502 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 GTF2H1P32780 548 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ZACNQ401N2 412 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 BEST2Q8NFU1 509 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 VPS16Q9H269 839 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 SIX4Q9UIU6 781 aa25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 NLRC5Q86WI3 1866 aa25.44■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 TNNC2P02585 160 aa25.44■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 MYOGP15173 224 aa25.44■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 AP3M2P53677 418 aa25.44■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 VWA3BQ502W6 1294 aa25.44■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.44■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 STX10O60499 249 aa25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 FMO5P49326 533 aa25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 RABGGTAQ92696 567 aa25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 NDST4Q9H3R1 872 aa25.43■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PPEF2O14830 753 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 VNN1O95497 513 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ITGB3P05106 788 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00271P0C7V0 271 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 LRPAP1P30533 357 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 MXI1P50539 228 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 CLCNKBP51801 687 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 KRT39Q6A163 491 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.42■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ANO9A1A5B4 782 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 CST3P01034 146 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 BIRC3Q13489 604 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 UPP1Q16831 310 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ITGA11Q9UKX5 1188 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 F8W810 466 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 LRRN2O75325 713 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 ARHGEF15O94989 841 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PBX3P40426 434 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 FANCCQ00597 558 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.41■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PIRO00625 290 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PBX2P40425 430 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 SLC11A1P49279 550 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 MYL7Q01449 175 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 FIBCD1Q8N539 461 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 SEMA4DQ92854 862 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PODXLO00592 558 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PMM2O15305 246 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 GALTP07902 379 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 KRT19P08727 400 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 RPL9P32969 192 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 UROC1Q96N76 676 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM175Q9BSA9 504 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PBX4Q9BYU1 374 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.39■■□□□ 1.66
PDSS1-201ENST00000376215 LGALS16A8MUM7 142 aa25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms