RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 ZSCAN30Q86W11 494 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 SIX4Q9UIU6 781 aa19.16■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PITPNM1O00562 1244 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 GPNMBQ14956 572 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ASIC2Q16515 512 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CD302Q8IX05 232 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 HELQQ8TDG4 1101 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ZFP42Q96MM3 310 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 KREMEN1Q96MU8 473 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 ARID3AQ99856 593 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 WNT8AQ9H1J5 351 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 CNTN3Q9P232 1028 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 FBXL5Q9UKA1 691 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 C2CD2Q9Y426 696 aa19.15■□□□□ 0.66
LTV1-201ENST00000367576 F8VZ95 297 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 GFPT2O94808 682 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 MLH1P40692 756 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 CYP26C1Q6V0L0 522 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 NECAB2Q7Z6G3 386 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 GPR88Q9GZN0 384 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 DPP3Q9NY33 737 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 NUB1Q9Y5A7 615 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 CITO14578 2027 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 DNAH12Q6ZR08 3092 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TANC1Q9C0D5 1861 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 EN2P19622 333 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 FECHP22830 423 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 USP8P40818 1118 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 MEA1Q16626 185 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ZNF699Q32M78 642 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TOX2Q96NM4 488 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 DESI2Q9BSY9 194 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 STK33Q9BYT3 514 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TMEM39AQ9NV64 488 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 PLAGL2Q9UPG8 496 aa19.14■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 RFX1P22670 979 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 STAT1P42224 750 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 RAB27AP51159 221 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TCTN1Q2MV58 587 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 C1orf53Q5VUE5 145 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 AGMOQ6ZNB7 445 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 HACE1Q8IYU2 909 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 DBF4BQ8NFT6 615 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 GAD1Q99259 594 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TBX21Q9UL17 535 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 AGAP1Q9UPQ3 857 aa19.13■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 PPEF2O14830 753 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP6O43182 974 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ASS1P00966 412 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 CLTBP09497 229 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 SOX5P35711 763 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 MFAP3P55082 362 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 DEFB128Q7Z7B8 93 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 TMTC1Q8IUR5 882 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 POLIQ9UNA4 740 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 DERAQ9Y315 318 aa19.12■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 A0A0U1RQF3 1178 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 PTGESO14684 152 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 HGSNATQ68CP4 663 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ECHDC2Q86YB7 292 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 BEST2Q8NFU1 509 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 CXorf38Q8TB03 319 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 RPS6KC1Q96S38 1066 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 XYLT2Q9H1B5 865 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ITGA11Q9UKX5 1188 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ESPNB1AK53 854 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 SCNN1GP51170 649 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 KLHL30Q0D2K2 578 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 CUL2Q13617 745 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB6Q15916 424 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa19.11■□□□□ 0.65
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms