RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365459.1

RNU6-609P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 609, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-609P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-609P-201ENST00000365459 CAPN8A6NHC0 703 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 TEX33O43247 280 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MATN4O95460 622 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 ITGB1P05556 798 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 KITP10721 976 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 NPR1P16066 1061 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 COMTP21964 271 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 CHN2P52757 468 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 CREMQ03060 361 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 NFIXQ14938 502 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 CCDC93Q567U6 631 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 METRNLQ641Q3 311 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 IL31Q6EBC2 164 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 TEX101Q9BY14 249 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 USP19O94966 1318 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 CFAP69A5D8W1 941 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 PMM2O15305 246 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 HRGP04196 525 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 SLC5A1P13866 664 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 IL12RB1P42701 662 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 NEK3P51956 506 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 SEMA5AQ13591 1074 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 FGL2Q14314 439 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 VPS72Q15906 364 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 RNF220Q5VTB9 566 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MED25Q71SY5 747 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 PJA1Q8NG27 643 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 LOXL4Q96JB6 756 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 POGKQ9P215 609 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 DRGXA6NNA5 263 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 SLC43A1O75387 559 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 POMCP01189 267 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MYL1P05976 194 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MYL3P08590 195 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 TMIEQ8NEW7 156 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 IL31RAQ8NI17 732 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MIEF2Q96C03 454 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 WDCPQ9H6R7 721 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-609P-201ENST00000365459 MFAP3LO75121 409 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 AGFG2O95081 481 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 ARIH2O95376 493 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 AMHP03971 560 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PEX2P28328 305 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PIK3CGP48736 1102 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 NOMO3P69849 1222 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 SLFN5Q08AF3 891 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 FZD5Q13467 585 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 FBLN7Q53RD9 439 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 ZNF365Q70YC5 407 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 FAM167AQ96KS9 214 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 ADOQ96SZ5 270 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 MNTQ99583 582 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 TLR10Q9BXR5 811 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 GPR87Q9BY21 358 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 E9PLN8 166 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 ZNF185O15231 689 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 HAUS5O94927 633 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 GJB1P08034 283 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 CTSWP56202 376 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 SOX8P57073 446 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 NHLH2Q02577 135 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-609P-201ENST00000365459 PLP2Q04941 152 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms