RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 STEAP3Q658P3 488 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CCDC174Q6PII3 467 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 LZTR1Q8N653 840 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CNBD1Q8NA66 436 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PHKBQ93100 1093 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MTA3Q9BTC8 594 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HACL1Q9UJ83 578 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TIAM2Q8IVF5 1701 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PQJ5 194 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CFAP69A5D8W1 941 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SLC27A2O14975 620 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 APOL3O95236 402 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HSD3B1P14060 373 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CHKAP35790 457 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PIK3CBP42338 1070 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PRIM2P49643 509 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 NFIXQ14938 502 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ZNF605Q86T29 641 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 FATE1Q969F0 183 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 FAM84AQ96KN4 292 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TBATAQ96M53 351 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 GBP4Q96PP9 640 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SLC38A3Q99624 504 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MYL10Q9BUA6 226 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 NARFQ9UHQ1 456 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PADI4Q9UM07 663 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 OR14I1A6ND48 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MAFGO15525 162 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SDHBP21912 280 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TNFSF4P23510 183 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PPM1AP35813 382 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 WASP42768 502 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HERVK_113P62684 666 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CDK17Q00537 523 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MVKQ03426 396 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TUSC3Q13454 348 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CCDC93Q567U6 631 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CCDC157Q569K6 752 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TSPEARQ8WU66 669 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HDAC10Q969S8 669 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MPP4Q96JB8 637 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CERS4Q9HA82 394 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 KCNK12Q9HB15 430 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ASB1Q9Y576 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CA12O43570 354 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TADA3O75528 432 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MYF5P13349 255 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 EDNRBP24530 442 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 EPHX2P34913 555 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SLC6A11P48066 632 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CASP5P51878 434 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ADCY2Q08462 1091 aa6.49□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 MESP2Q0VG99 397 aa6.49□□□□□ -1.37
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