RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 SEPT8Q92599 483 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 HPDLQ96IR7 371 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 KCNA4P22459 653 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 LIG3P49916 1009 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 FAM83AQ86UY5 434 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 CD302Q8IX05 232 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 HPS3Q969F9 1004 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 SNF8Q96H20 258 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 PLAAQ9Y263 795 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 PIK3R2O00459 728 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 FAM200BP0CF97 657 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 ODC1P11926 461 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 P3H1Q32P28 736 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 RASSF3Q86WH2 238 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 EHD4Q9H223 541 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 H7C4K7 107 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 SLC26A2P50443 739 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 MTHFD1LQ6UB35 978 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRO-202ENST00000348962 CFAP99D6REC4 459 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CHSY1Q86X52 802 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 MFN1Q8IWA4 741 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ATL2Q8NHH9 583 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 TMX2Q9Y320 296 aa16.27■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CXCL11O14625 94 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 B3GAT3O94766 335 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 MYBP10242 640 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 KLRK1P26718 216 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 AKT1P31749 480 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ANTXR2P58335 489 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SCFD1Q8WVM8 642 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ABCB6Q9NP58 842 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ADGRG1Q9Y653 693 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 UCHL3P15374 230 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SYTL3Q4VX76 610 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 BTBD6Q96KE9 485 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SPATA17Q96L03 361 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 TEX12Q9BXU0 123 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CPA4Q9UI42 421 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ITM2BQ9Y287 266 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 A0A0G2JND7 137 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CFAP69A5D8W1 941 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 DCTN3O75935 186 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ARSEP51690 589 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 KRT35Q92764 455 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 DPF3Q92784 378 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 RALBP11234 206 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 PMS2P54278 862 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 STK4Q13043 487 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 UGP2Q16851 508 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 IRF1P10914 325 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 RNF135Q8IUD6 432 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 VPS33BQ9H267 617 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 FOXP2O15409 715 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 KCNN4O15554 427 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 MUTP22033 750 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ATICP31939 592 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 OPTNQ96CV9 577 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 SLC2A3P11169 496 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRO-202ENST00000348962 ESRRGP62508 458 aa16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms