RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000175752.7

Apobec3-205, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Med15Q924H2 789 aa11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Rfc4Q99J62 364 aa11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 QpctQ9CYK2 362 aa11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Fam111aQ9D2L9 613 aa11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Clec4aQ9QZ15 238 aa11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa11.11□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Nme9A0A1L1SUL6 329 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Sh2d4bA6X942 431 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Gm3182K7N6T8 263 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 NumblO08919 604 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 UncxO08934 530 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ptp4a2O70274 167 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Akap10O88845 662 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Vav1P27870 845 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Scarf2P59222 833 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 NfiaQ02780 532 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ntrk1Q3UFB7 799 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Nt5c2Q3V1L4 560 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Akap4Q60662 849 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Pde1aQ61481 565 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Capn3Q64691 821 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 IgflQ6B9Z0 140 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Capn11Q6J756 714 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Zswim6Q80TB7 1207 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ccdc151Q8BSN3 593 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Pak4Q8BTW9 593 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 SowahdQ8BY98 327 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Cadps2Q8BYR5 1297 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Pls3Q99K51 630 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ears2Q9CXJ1 523 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 CpvlQ9D3S9 478 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Eya4Q9Z191 616 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Nup188Q6ZQH8 1759 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Robo3Q9Z2I4 1366 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Prdm15E9Q8T2 1174 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 PtgisO35074 501 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Rrm1P07742 792 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Grm2Q14BI2 872 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Agap2Q3UHD9 1186 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Orai2Q8BH10 250 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Slc9a9Q8BZ00 644 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Lmo3Q8BZL8 145 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Sh2d5Q8JZW5 429 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 TgdsQ8VDR7 355 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 StambpQ9CQ26 424 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Isl2Q9CXV0 359 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Slc25a19Q9DAM5 318 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 HemgnQ9ERZ0 503 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Rnf25Q9QZR0 456 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ltn1Q6A009 1767 aa11.1□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Col18a1P39061 1774 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Kcnh4A2A5F7 1018 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Gm16430A6X8J1 155 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 4933406M09RikG3XA12 479 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Myl4P09541 193 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Cyp2a4P15392 494 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Cyp2a5P20852 494 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Nedd1P33215 660 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Stat3P42227 770 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Usp46P62069 366 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Stx2Q00262 289 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Fam83bQ0VBM2 1012 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Fam172aQ3TNH5 417 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Islr2Q5RKR3 745 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Atp13a4Q5XF90 1193 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Fam185aQ7TPD2 378 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 TdrkhQ80VL1 560 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Crybg3Q80W49 1005 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Tmem179Q8BHH9 233 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Tgm6Q8BM11 706 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Trim14Q8BVW3 440 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Svs3bQ8BZH8 265 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Tbc1d10cQ8C9V1 444 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Slc26a6Q8CIW6 758 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Rev1Q920Q2 1249 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Dqx1Q924H9 718 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 GatbQ99JT1 557 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Med21Q9CQ39 144 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Josd2Q9CR30 188 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Slxl1Q9D515 155 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Tcirg1Q9JHF5 834 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 MycsQ9Z304 431 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Ltbp2O08999 1813 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-205ENSMUST00000175752 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms