RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616894.1

ATRNL1-210, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATRNL1, Length 1,701 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-210ENST00000616894 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 FUT10Q6P4F1 479 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM130Q8N3G9 435 aa25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TTC26A0AVF1 554 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 NCK2O43639 380 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TBX10O75333 385 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TADA2AO75478 443 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 PRR29P0C7W0 189 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ADAM15Q13444 863 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 PTPN14Q15678 1187 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 EFHBQ8N7U6 833 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 B3GALT6Q96L58 329 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ASB2Q96Q27 587 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.16■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 LACTBL1A8MY62 500 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 C2CD2LO14523 706 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 GLP2RO95838 553 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 HOXD13P35453 343 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 KYAT1Q16773 422 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM212AQ96EL1 285 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM206Q9H813 350 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 STK39Q9UEW8 545 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 UPP1Q16831 310 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 IRAK3Q9Y616 596 aa25.15■■□□□ 1.62
ATRNL1-210ENST00000616894 VWA8A3KMH1 1905 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 NDUFV1P49821 464 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 SAAL1Q96ER3 474 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 KIF12Q96FN5 646 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 B3GAT3O94766 335 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 URODP06132 367 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 POSTNQ15063 836 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CLUL1Q15846 466 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 AAK1Q2M2I8 961 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 UROC1Q96N76 676 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 GLUD2P49448 558 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 NELFCDQ8IXH7 590 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 EXOC1Q9NV70 894 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CLEC1BQ9P126 229 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 PODXLO00592 558 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 LILRB3O75022 631 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 MYL1P05976 194 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 ADRB2P07550 413 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 KCNC3Q14003 757 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 TJAP1Q5JTD0 557 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CHST7Q9NS84 486 aa25.12■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 GARTP22102 1010 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 DSG1Q02413 1049 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 STK4Q13043 487 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 USP41Q3LFD5 358 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 FAM171A1Q5VUB5 890 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 JADE1Q6IE81 842 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 KIAA1841Q6NSI8 718 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.11■■□□□ 1.61
ATRNL1-210ENST00000616894 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.1■■□□□ 1.61
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