RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 B3GAT3O94766 335 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 CD72P21854 359 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 FGFR3P22607 806 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLCNKBP51801 687 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDXDC1Q6P996 788 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
VIM-AS1-202ENST00000605833 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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VIM-AS1-202ENST00000605833 BRCC3P46736 316 aa22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF174Q15697 407 aa22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ERMNQ8TAM6 284 aa22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEP250Q9BV73 2442 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 RPA1P27694 616 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ECM1Q16610 540 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEP120Q8N960 986 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 BCO2Q9BYV7 579 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.94■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 POU2F2P09086 479 aa22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRKCQQ04759 706 aa22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP2R5AQ15172 486 aa22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 POTEHQ6S545 545 aa22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 RUBCNQ92622 972 aa22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM170BA6NMN3 283 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CEBPBP17676 345 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 NEK4P51957 841 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 OSTNP61366 133 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 UPP1Q16831 310 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 UVSSAQ2YD98 709 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 IFT74Q96LB3 600 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CITO14578 2027 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 LAMTOR5O43504 91 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 KINO60870 393 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 RHOP08100 348 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 PFKPQ01813 784 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.91■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 EFNA5P52803 228 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARPP19P56211 112 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ROR1Q01973 937 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 NBR1Q14596 966 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 UROC1Q96N76 676 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDT1Q9H211 546 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 COL4A2P08572 1712 aa22.89■■□□□ 1.26
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDR27A2RRH5 827 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 TTC38Q5R3I4 469 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIFAP3Q92845 792 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 C8orf76Q96K31 380 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.89■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC169A6NNP5 214 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 K7ERI5 159 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRRG1O14668 218 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRAPPC3O43617 180 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 ECI2O75521 394 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 LRG1P02750 347 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 GRM5P41594 1212 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 TSSK4Q6SA08 328 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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VIM-AS1-202ENST00000605833 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.88■■□□□ 1.25
VIM-AS1-202ENST00000605833 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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