RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598020.3

PNKP-211, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-211ENST00000598020 IL18RAPO95256 599 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 CYP3A5P20815 502 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 BMP6P22004 513 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 ADGRE1Q14246 886 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 STK39Q9UEW8 545 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 C2CD2Q9Y426 696 aa22.09■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 ZNF233A6NK53 670 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 GRM6O15303 877 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 OR1G1P47890 313 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 KRT17Q04695 432 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 CENPPQ6IPU0 288 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 TMEM169Q96HH4 297 aa22.08■■□□□ 1.13
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PNKP-211ENST00000598020 MARCH5Q9NX47 278 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.08■■□□□ 1.13
PNKP-211ENST00000598020 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 EFEMP2O95967 443 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 NR3C1P04150 777 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CYP2J2P51589 502 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CAMK1Q14012 370 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PTPROQ16827 1216 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 MYLIPQ8WY64 445 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 KIF12Q96FN5 646 aa22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CDH23Q9H251 3354 aa22.07■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 STIM1Q13586 685 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 SURF1Q15526 300 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 UPP1Q16831 310 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 ISM2Q6H9L7 571 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 JADE1Q6IE81 842 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 FAM212AQ96EL1 285 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 MYO7AQ13402 2215 aa22.06■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.05■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 BIN1O00499 593 aa22.05■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 EXOC3O60645 756 aa22.05■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.05■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.05■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 PSMA7O14818 248 aa22.04■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 MAPK13O15264 365 aa22.04■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 NFICP08651 508 aa22.04■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PTMSP20962 102 aa22.04■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 TLR9Q9NR96 1032 aa22.04■■□□□ 1.12
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PNKP-211ENST00000598020 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.04■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.04■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 FSCN2O14926 492 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 FOSL2P15408 326 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 NR2F2P24468 414 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CCNE1P24864 410 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CYP24A1Q07973 514 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 PSMD6Q15008 389 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 BEST2Q8NFU1 509 aa22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PNKP-211ENST00000598020 TSG101Q99816 390 aa22.03■■□□□ 1.12
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