RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-211ENST00000592658 VWA8A3KMH1 1905 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 TM4SF5O14894 197 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 HRO43593 1189 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MARCH6O60337 910 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 DGAT1O75907 488 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FCARP24071 287 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CCR3P51677 355 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 DMWDQ09019 674 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RAB33AQ14088 237 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PPP2R5DQ14738 602 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RTL10Q7L3V2 364 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CEP57Q86XR8 500 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FAM205CA6NFA0 338 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MAN2B1O00754 1011 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PTGESO14684 152 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 LYPLA2O95372 231 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RARRES1P49788 294 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SATB1Q01826 763 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 GAS6Q14393 721 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 F5P12259 2224 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 DTNBO60941 627 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RHOP08100 348 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CEBPBP17676 345 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 LIMK1P53667 647 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 NAB2Q15742 525 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PDXDC1Q6P996 788 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 LMAN1LQ9HAT1 526 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.62□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 A0A087WWV3 80 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PROS1P07225 676 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CHRNB1P11230 501 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CNR2P34972 360 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 OR1D2P34982 312 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CXCL12P48061 93 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 GRM2Q14416 872 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FAM3CQ92520 227 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 BRD9Q9H8M2 597 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SNTG2Q9NY99 539 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MTRRQ9UBK8 725 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 LAMA5O15230 3695 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 STK36Q9NRP7 1315 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 K7ESF4 209 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 RECQL4O94761 1208 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 BAG4O95429 457 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 THP07101 528 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 KCNA4P22459 653 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FGFR3P22607 806 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 FNTBP49356 437 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 SCRN1Q12765 414 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 IL31Q6EBC2 164 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-211ENST00000592658 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms