RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582699.1

MIR3170-201, Transcript of microRNA 3170, humanhuman

BASIC

Gene MIR3170, Length 77 nt, Biotype miRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3170-201ENST00000582699 KRT39Q6A163 491 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ALKBH2Q6NS38 261 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TAS1R1Q7RTX1 841 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 CMTM4Q8IZR5 234 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 MMP21Q8N119 569 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 Q8N1Y9 231 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 RFLNBQ8N5W9 214 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ENGASEQ8NFI3 743 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 CLEC4DQ8WXI8 215 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 BRF1Q92994 677 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 DHRS1Q96LJ7 313 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TRIM55Q9BYV6 548 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 MTFR1LQ9H019 292 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 CDT1Q9H211 546 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 EPC1Q9H2F5 836 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 NCDNQ9UBB6 729 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 REV1Q9UBZ9 1251 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 WWC3Q9ULE0 1092 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 HDAC5Q9UQL6 1122 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 VWA7Q9Y334 891 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 GAKO14976 1311 aa-0.49□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 C2orf78A6NCI8 922 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 FAM83GA6ND36 823 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 FAM196BA6NMK8 535 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 STXBP3O00186 592 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SLC27A2O14975 620 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SLC16A5O15375 505 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 DNAJA2O60884 412 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 KRT6AP02538 564 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 KRT6BP04259 564 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ELANEP08246 267 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ARP10275 920 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ALDH4A1P30038 563 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 KRT6CP48668 564 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZNF445P59923 1031 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 CD83Q01151 205 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 GHRHRQ02643 423 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ST3GAL1Q11201 340 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 MTMR3Q13615 1198 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 WASHC2DQ5SRD0 308 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 C9orf57Q5W0N0 161 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 CEP85Q6P2H3 762 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 NXPE4Q6UWF7 544 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 LRRTM1Q86UE6 522 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 MORC1Q86VD1 984 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 C3orf58Q8NDZ4 430 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZPLD1Q8TCW7 415 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 HERVK_113Q902F9 699 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 NACC2Q96BF6 587 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TMEM169Q96HH4 297 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 DDRGK1Q96HY6 314 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 FBXL20Q96IG2 436 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 WNK4Q96J92 1243 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 NLRP4Q96MN2 994 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZDHHC15Q96MV8 337 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ASB2Q96Q27 587 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 MCMBPQ9BTE3 642 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 BCO2Q9BYV7 579 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZNF696Q9H7X3 374 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 GALNT9Q9HCQ5 603 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TCF7L1Q9HCS4 588 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TMEM74BQ9NUR3 256 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZNRF3Q9ULT6 936 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ARID1AO14497 2285 aa-0.5□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ADM5C9JUS6 153 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 ZNF213O14771 459 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 DSCR3O14972 297 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 SHOXO15266 292 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 DGKIO75912 1065 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 TOX4O94842 621 aa-0.51□□□□□ -2.49
MIR3170-201ENST00000582699 PPP1R3DO95685 299 aa-0.51□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms