RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 CHST7Q9NS84 486 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TCHHQ07283 1943 aa22.98■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 B3GAT3O94766 335 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 CLCNKBP51801 687 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ALCAMQ13740 583 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 CES5AQ6NT32 575 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 CEP57Q86XR8 500 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 GPR65Q8IYL9 337 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 GJD3Q8N144 294 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 B3GALT6Q96L58 329 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ACCSQ96QU6 501 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.97■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TTC28Q96AY4 2481 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 A0A0B4J269 797 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TRAPPC3O43617 180 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 CXCL8P10145 99 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 EPCAMP16422 314 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 UPP1Q16831 310 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 TTPALQ9BTX7 342 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 DPP7Q9UHL4 492 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 PLXNA3P51805 1871 aa22.96■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.95■■□□□ 1.27
SNAP23-216ENST00000568331 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 TEX28O15482 410 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 TNFSF9P41273 254 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 CLCN4P51793 760 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ASIC1P78348 528 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ADALQ6DHV7 355 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PDXDC1Q6P996 788 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 FBXL18Q96ME1 805 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 TRIM9Q9C026 710 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 S1PR5Q9H228 398 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PODXLO00592 558 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PPP1R37O75864 691 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ZP2Q05996 745 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ITIH3Q06033 890 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 POSTNQ15063 836 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 FAM212AQ96EL1 285 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 KIF12Q96FN5 646 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 STRA6Q9BX79 667 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 FNIP2Q9P278 1114 aa22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 NCOR1O75376 2440 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 TTC26A0AVF1 554 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 GLUD1P00367 558 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 MYBP10242 640 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 RTP2Q5QGT7 225 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.93■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 VWA8A3KMH1 1905 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 LACTBL1A8MY62 500 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 NUCB2P80303 420 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SPAG1Q07617 926 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PSMD5Q16401 504 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PALB2Q86YC2 1186 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 CD302Q8IX05 232 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SUSD6Q92537 303 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms