RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPT2Q8TD30 523 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF12Q96FN5 646 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.78■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CARNS1A5YM72 827 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 BIN1O00499 593 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF20AO95235 890 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE3AQ05086 875 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 JADE1Q6IE81 842 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDXKO00764 312 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRCPP42785 496 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLCNKBP51801 687 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 WNT7BP56706 349 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERVFC1P60507 584 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 RDH13Q8NBN7 331 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 LZTS1Q9Y250 596 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.76■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFICP08651 508 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRS1P35568 1242 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB6Q15916 424 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD302Q8IX05 232 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 HASPINQ8TF76 798 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLR9Q9NR96 1032 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL6A3P12111 3177 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF4AO95239 1232 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPM1EQ8WY54 764 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASB7Q9H672 318 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.75■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF233A6NK53 670 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TADA2AO75478 443 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL18RAPO95256 599 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP6P22004 513 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 GUCY2FP51841 1108 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 MORC3Q14149 939 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 UPP1Q16831 310 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS52Q8N1B4 723 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXL18Q96ME1 805 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 UROC1Q96N76 676 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.74■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOC3O60645 756 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 NR3C1P04150 777 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMC7Q7Z402 723 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCF25Q9BQ70 676 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 DMAC2Q9NW81 257 aa22.73■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PODXLO00592 558 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 B3GAT3O94766 335 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM4P33991 863 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADSSL1Q8N142 457 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 DERAQ9Y315 318 aa22.72■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 FSCN2O14926 492 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA1Q5VX52 437 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 FUT10Q6P4F1 479 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.71■■□□□ 1.23
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM84AQ96KN4 292 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms