RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPM1E	Q8WY54	764 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	DERA	Q9Y315	318 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.05	□□□□□ -0.32	1e-8	■■■■■ 160.4
SLC8B1-205	ENST00000548518	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLIC2	O15247	247 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	NCK2	O43639	380 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM189A1	O60320	539 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	EXOC3	O60645	756 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	UROD	P06132	367 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	CYP3A5	P20815	502 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	CYP2J2	P51589	502 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	TSG101	Q99816	390 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	PODXL	O00592	558 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	B4GALT3	O60512	393 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	B3GAT3	O94766	335 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	SOD2	P04179	222 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADRB2	P07550	413 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	USP37	Q86T82	979 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PSMA7	O14818	248 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MBD3	O95983	291 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CTSA	P10619	480 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PAX3	P23760	479 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNAJB1	P25685	340 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	HOXD13	P35453	343 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	GLUD2	P49448	558 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLCNKB	P51801	687 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CREM	Q03060	361 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPAG1	Q07617	926 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	NAB2	Q15742	525 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CAMK4	Q16566	473 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	UPP1	Q16831	310 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.02	□□□□□ -0.33
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.02	□□□□□ -0.33

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