RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MIER3Q7Z3K6 550 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PDZD3Q86UT5 571 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MFSD6LQ8IWD5 586 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RNF149Q8NC42 400 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SMARCD2Q92925 531 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CCDC51Q96ER9 411 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 TRPV4Q9HBA0 871 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 KLK13Q9UKR3 277 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MSRB2Q9Y3D2 182 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 LNP1A1A4G5 178 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MYBPHLA2RUH7 354 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CHMLP26374 656 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SPIRE1Q08AE8 756 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 TUSC3Q13454 348 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DGKKQ5KSL6 1271 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 APOA5Q6Q788 366 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CD300LGQ6UXG3 332 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 FERMT3Q86UX7 667 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PROSER1Q86XN7 944 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 KIF12Q96FN5 646 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MSANTD3Q96H12 275 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CORO1BQ9BR76 489 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CDY1Q9Y6F8 540 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SLC38A8A6NNN8 435 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 HEPACAM2A8MVW5 462 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PTGESO14684 152 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SGSM2O43147 1006 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 B4GALT5O43286 388 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ERLIN2O94905 339 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CTHP32929 405 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PTENP60484 403 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PDXDC1Q6P996 788 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SPAG17Q6Q759 2223 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 EML1O00423 815 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 AKAP3O75969 853 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ABLIM3O94929 683 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SEC24AO95486 1093 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CCDC192P0DO97 292 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 GJA1P17302 382 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CDC27P30260 824 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PSMC5P62195 406 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MBTD1Q05BQ5 628 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 FCHO2Q0JRZ9 810 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PON2Q15165 354 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DEFB124Q8NES8 71 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ADAM32Q8TC27 787 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SLC7A3Q8WY07 619 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SNTG2Q9NY99 539 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 EML5Q05BV3 1969 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 FAM221BA6H8Z2 402 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ZNF197O14709 1029 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CHADO15335 359 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 NPTXRO95502 500 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CAVIN2O95810 425 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 IGHDP01880 384 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ROR1Q01973 937 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RTN1Q16799 776 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 COL28A1Q2UY09 1125 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 Q4G0T1 1027 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 C1orf228Q6PIY5 440 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 SYNPOQ8N3V7 929 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 TTC8Q8TAM2 541 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CEP170P1Q96L14 293 aa12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms