RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM174Q8WUU8 243 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GSDMAQ96QA5 445 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZBP1Q9H171 429 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ASB7Q9H672 318 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC39A2Q9NP94 309 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C2CD2Q9Y426 696 aa17.87■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 REV3LO60673 3130 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TISP43B9A030 160 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IL18RAPO95256 599 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFEMP2O95967 443 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CYP3A5P20815 502 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DNAJB1P25685 340 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPL9P32969 192 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HOXD13P35453 343 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNFSF9P41273 254 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STK4Q13043 487 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GLRA4Q5JXX5 417 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA20Q8TB22 786 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCF25Q9BQ70 676 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIAA1586Q9HCI6 787 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IRAK3Q9Y616 596 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRWD1Q9NSI6 2320 aa17.86■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASTOR2A6NHX0 329 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EXTL3O43909 919 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOD2P04179 222 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CTSAP10619 480 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL19A1Q14993 1142 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRSK2Q8IWQ3 736 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPD1LQ8N335 351 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MICALL1Q8N3F8 863 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CBWD1Q9BRT8 395 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADAM28Q9UKQ2 775 aa17.85■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TGFB1I1O43294 461 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACOT2P49753 483 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PNOCQ13519 176 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UPP1Q16831 310 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SEZ6Q53EL9 994 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COBLL1Q53SF7 1204 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FUT10Q6P4F1 479 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VPS52Q8N1B4 723 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SMARCE1Q969G3 411 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXL18Q96ME1 805 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CXCL16Q9H2A7 254 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COG5Q9UP83 839 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VWA8A3KMH1 1905 aa17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LACTBL1A8MY62 500 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDXKO00764 312 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF4AO95239 1232 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 URODP06132 367 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PAX3P23760 479 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LRPAP1P30533 357 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IRS1P35568 1242 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERVFC1P60507 584 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CREMQ03060 361 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYBPC2Q14324 1141 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZBTB6Q15916 424 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCEAL5Q5H9L2 206 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM213AQ9BRX8 229 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VN1R3Q9BXE9 311 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IKZF4Q9H2S9 585 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSPBP1Q9NZL4 362 aa17.83■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAPPC3O43617 180 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TADA2AO75478 443 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM132DQ14C87 1099 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SURF1Q15526 300 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NFIL3Q16649 462 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLPP4Q5VZY2 271 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMC7Q7Z402 723 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC9A9Q8IVB4 645 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NELFCDQ8IXH7 590 aa17.82■□□□□ 0.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms