RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 IQCEQ6IPM2 695 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.77■□□□□ 0.28
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TRPS1-206ENST00000517323 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-206ENST00000517323 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.77■□□□□ 0.28
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TRPS1-206ENST00000517323 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.76■□□□□ 0.27
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TRPS1-206ENST00000517323 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.75■□□□□ 0.27
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TRPS1-206ENST00000517323 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.74■□□□□ 0.27
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TRPS1-206ENST00000517323 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.74■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.74■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa16.73■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 CLTBP09497 229 aa16.73■□□□□ 0.27
TRPS1-206ENST00000517323 FGFR1P11362 822 aa16.73■□□□□ 0.27
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