RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB34Q8NCN2 500 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZFP28Q8NHY6 868 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 RGMAQ96B86 450 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM89AQ96GI7 184 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM167AQ96KS9 214 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MNTQ99583 582 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYOCQ99972 504 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPC1Q9H2F5 836 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM11Q9NQV5 511 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 L1RE1Q9UN81 338 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 A6NNZ2 444 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 K7ESM1 405 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 F2RL2O00254 374 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC43A1O75387 559 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 POMCP01189 267 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 FTLP02792 175 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMHP03971 560 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAP2AP10114 183 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 TYRP14679 529 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTR1BP28222 390 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDX5P30044 214 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP14P54578 494 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFEMP1Q12805 493 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GALEQ14376 348 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 FLYWCH1Q4VC44 716 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFCAB12Q6NXP0 572 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYT12Q8IV01 421 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 TFAP2CQ92754 450 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 LOXL4Q96JB6 756 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLC2Q9H0B6 622 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEF6Q9H4E7 631 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDCPQ9H6R7 721 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMBRD1Q9NUN5 540 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 DRGXA6NNA5 263 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAPN14A8MX76 684 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRXCR1A8MXD5 290 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GRM6O15303 877 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP27B1O15528 508 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SBK3P0C264 359 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MGAT1P26572 445 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMARCA1P28370 1054 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC6A4P31645 630 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNALP38405 381 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCNN1GP51170 649 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLS1Q14651 629 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP2B3Q16720 1220 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANO6Q4KMQ2 910 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF529Q6P280 563 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC4A10Q6U841 1118 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPNTQ6UXI9 565 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q6ZRM9 215 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 GSTO2Q9H4Y5 243 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPON1Q9HCB6 807 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PNPOQ9NVS9 261 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCF2Q9UG63 623 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BUI4 141 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRC1O43663 620 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBED1O96006 694 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms