RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	EPN3	Q9H201	632 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	GGA2	Q9UJY4	613 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SAMM50	Q9Y512	469 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MYH10	P35580	1976 aa		5.36	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	NFASC	O94856	1347 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	DENND3	A2RUS2	1198 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CCDC169	A6NNP5	214 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TNFRSF10A	O00220	468 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	EBAG9	O00559	213 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PODXL	O00592	558 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	FSCN2	O14926	492 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SIAH2	O43255	324 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ZEB2	O60315	1214 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PHF2	O75151	1096 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ATG7	O95352	703 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	EGFR	P00533	1210 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MME	P08473	750 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MYZAP	P0CAP1	466 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	RARA	P10276	462 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PYGM	P11217	842 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CYP11B1	P15538	503 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	KCNA2	P16389	499 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	NR1D1	P20393	614 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	GART	P22102	1010 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CCND2	P30279	289 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CHRNA3	P32297	505 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	LSP1	P33241	339 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	COPB2	P35606	906 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	USP8	P40818	1118 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CCT5	P48643	541 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MXI1	P50539	228 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ATP1A2	P50993	1020 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SMTN	P53814	917 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	OAZ1	P54368	228 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	BACE1	P56817	501 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TGFB2	P61812	414 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CLDN10	P78369	228 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	DR1	Q01658	176 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CYP24A1	Q07973	514 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SLC20A2	Q08357	652 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	FOXC1	Q12948	553 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PDCL	Q13371	301 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MTMR3	Q13615	1198 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MESD	Q14696	234 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TTC27	Q6P3X3	843 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SV2A	Q7L0J3	742 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	GLG1	Q92896	1179 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CENPT	Q96BT3	561 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	ATG4C	Q96DT6	458 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	WNK4	Q96J92	1243 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CEP170P1	Q96L14	293 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	C12orf42	Q96LP6	360 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		5.35	□□□□□ -1.55
IFT122-231	ENST00000514275	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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