RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACAP3	Q96P50	834 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRRX2	Q99811	253 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TLR9	Q9NR96	1032 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	NRP1	O14786	923 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FSCN2	O14926	492 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	EFEMP2	O95967	443 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLTA	P09496	248 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	OSTN	P61366	133 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRT17	Q04695	432 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCF15	Q12870	199 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBXL6	Q8N531	539 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUSD6	Q92537	303 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	HPS3	Q969F9	1004 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNX27	Q96L92	541 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ACCS	Q96QU6	501 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	MARCH5	Q9NX47	278 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TISP43	B9A030	160 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	OGT	O15294	1046 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TH	P07101	528 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADRB2	P07550	413 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNE1	P15382	129 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADSS	P30520	456 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	HOXD13	P35453	343 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERVFC1	P60507	584 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TUSC3	Q13454	348 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	KYAT1	Q16773	422 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	DUSP6	Q16828	381 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	SEZ6	Q53EL9	994 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM169	Q96HH4	297 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	CNTN3	Q9P232	1028 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TTC26	A0AVF1	554 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	FSD2	A1L4K1	749 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM206	Q9H813	350 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRIP11	Q15643	1979 aa		18.83	■□□□□ 0.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNFSF9	P41273	254 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPYD	Q12882	1025 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	POSTN	Q15063	836 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ASIC4	Q96FT7	647 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	CIT	O14578	2027 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	NR1I2	O75469	434 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR1G1	P47890	313 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCNC3	Q14003	757 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZBTB6	Q15916	424 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		18.82	■□□□□ 0.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		18.82	■□□□□ 0.6

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