RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 SUSD3Q96L08 255 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FIZ1Q96SL8 496 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TBX20Q9UMR3 447 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GINS2Q9Y248 185 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GRIN2DO15399 1336 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PDXKO00764 312 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PARNO95453 639 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TPM2P07951 284 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 SPAG1Q07617 926 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 NFIL3Q16649 462 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FAM187BQ17R55 369 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 KIZQ2M2Z5 673 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CENPPQ6IPU0 288 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ZPBP2Q6X784 338 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 AOPEPQ8N6M6 819 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 USP38Q8NB14 1042 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB10Q96DT7 871 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TOX2Q96NM4 488 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 OSMRQ99650 979 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC113Q9H0I3 377 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GPAMQ9HCL2 828 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 DCTN4Q9UJW0 460 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WZ62 844 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FZD6O60353 706 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GNA14O95837 355 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PIGRP01833 764 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 F11P03951 625 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CTSHP09668 335 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 DARSP14868 501 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PTSQ03393 145 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 RBL2Q08999 1139 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM62Q0P6H9 643 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 MYBPC2Q14324 1141 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 SPATA1Q5VX52 437 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CATSPER4Q7RTX7 472 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 USP37Q86T82 979 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TREML1Q86YW5 311 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 KSR1Q8IVT5 923 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC51Q96ER9 411 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CEP63Q96MT8 703 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 STRA6Q9BX79 667 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 KCTD10Q9H3F6 313 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CBX8Q9HC52 389 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 POLD4Q9HCU8 107 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CDY2AQ9Y6F7 541 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PNR3 127 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 SLC35F4A4IF30 521 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 ACKR2O00590 384 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 N4BP3O15049 544 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CETN3O15182 167 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GPR32O75388 356 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TOM1L1O75674 476 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 NR3C1P04150 777 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 TPM3P06753 285 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 EPB41P11171 864 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 GARTP22102 1010 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 NR2F2P24468 414 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 AXLP30530 894 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 CDK7P50613 346 aa10.59□□□□□ -0.71
CTPS1-211ENST00000497210 STX17P56962 302 aa10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms