RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496935.1

DENND1B-210, Transcript of DENN domain containing 1B, humanhuman

TSL 2

Gene DENND1B, Length 2,137 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1B-210ENST00000496935 STAMQ92783 540 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 TP53INP1Q96A56 240 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 CALML4Q96GE6 196 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 HES6Q96HZ4 224 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 HINFPQ9BQA5 517 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 SYT15Q9BQS2 421 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 PPCSQ9HAB8 311 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 POLD4Q9HCU8 107 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.469e-11■■■■■ 86.5
DENND1B-210ENST00000496935 CCDC87Q9NVE4 849 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 BLOC1S6Q9UL45 172 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.9□□□□□ -1.46
DENND1B-210ENST00000496935 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 A8MXQ7 604 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 CETN3O15182 167 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 BIRC5O15392 142 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 TTI1O43156 1089 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PHF2O75151 1096 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 DKK1O94907 266 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 H2AFZP0C0S5 128 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 IDO1P14902 403 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 KCNA3P22001 575 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 MARK3P27448 753 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PTPN4P29074 926 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 MAN1A1P33908 653 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 MCM7P33993 719 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 POLE2P56282 527 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 IL9RQ01113 521 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 SULT2A1Q06520 285 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 MAPK7Q13164 816 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 MYBPC3Q14896 1274 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 USH1GQ495M9 461 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 KLC3Q6P597 504 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 H2AFVQ71UI9 128 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 CABP7Q86V35 215 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 VSIG1Q86XK7 387 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 TBC1D5Q92609 795 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 NDNQ99608 321 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 DPH5Q9H2P9 285 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 SENP1Q9P0U3 644 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 NENFQ9UMX5 172 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PCDHA4Q9UN74 947 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 ALS2Q96Q42 1657 aa5.9□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 FLT1P17948 1338 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 GSG1L2A8MUP6 293 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 TCP11X1B4DZS4 312 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 IDH1O75874 414 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 CSF1RP07333 972 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 ADORA1P30542 326 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 GSTT1P30711 240 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 STX2P32856 288 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 CACNA2D1P54289 1103 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 XIAPP98170 497 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 AP1B1Q10567 949 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 LSAMPQ13449 338 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 RAPGEF1Q13905 1077 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 CCINQ13939 588 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 IL17AQ16552 155 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 HIF1AQ16665 826 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 SV2BQ7L1I2 683 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 DAAM2Q86T65 1068 aa5.89□□□□□ -1.47
DENND1B-210ENST00000496935 FAM35AQ86V20 835 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms