RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292		O00370	1275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ICA1	Q05084	483 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	VSTM1	Q6UX27	236 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ASTN1	O14525	1302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ABL2	P42684	1182 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MTFR1	Q15390	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	WDR44	Q5JSH3	913 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CCNJL	Q8IV13	435 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SYT15	Q9BQS2	421 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CD209	Q9NNX6	404 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	EML1	O00423	815 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TRPA1	O75762	1119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ETS1	P14921	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TAC1	P20366	129 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RPA1	P27694	616 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	COG7	P83436	770 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MTMR2	Q13614	643 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RASA3	Q14644	834 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	STAT4	Q14765	748 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ANO7	Q6IWH7	933 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ESYT2	A0FGR8	921 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TUB	P50607	506 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TCHP	Q9BT92	498 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SLIT3	O75094	1523 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	EYA4	O95677	639 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	RRM1	P23921	792 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ADRA1D	P25100	572 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PTGIR	P43119	386 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PPAT	Q06203	517 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GRIK3	Q13003	919 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TMED1	Q13445	227 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1W2PPM1	405 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MSH4	O15457	936 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC22	O60826	627 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	VCX3B	Q9H321	246 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SIX2	Q9NPC8	291 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CHKB	Q9Y259	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM86B1	E9PN63	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	CREB3	O43889	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	INHBA	P08476	426 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TMPRSS15	P98073	1019 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	BTK	Q06187	659 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAF1	Q13077	416 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	USP4	Q13107	963 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ERCC3-208	ENST00000491292	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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