RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484454.1

TARBP1-208, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene TARBP1, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP1-208	ENST00000484454	RAP2B	P61225	183 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	GRM7	Q14831	915 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	RNF220	Q5VTB9	566 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SLFN13	Q68D06	897 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	CPA4	Q9UI42	421 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	GRM6	O15303	877 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	TEX33	O43247	280 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ARIH2	O95376	493 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	AHSG	P02765	367 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ATP5J	P18859	108 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PHKA1	P46020	1223 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM193A	P78312	1265 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	CREM	Q03060	361 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PTH1R	Q03431	593 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FGL2	Q14314	439 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SURF1	Q15526	300 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	CSRP2	Q16527	193 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	APOA5	Q6Q788	366 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	GOLIM4	O00461	696 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FOXS1	O43638	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	KIT	P10721	976 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC5A1	P13866	664 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PEX2	P28328	305 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PRDX5	P30044	214 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SLC6A4	P31645	630 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	GPSM2	P81274	684 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FOXL1	Q12952	345 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PICALM	Q13492	652 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FUK	Q8N0W3	1084 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	RNF169	Q8NCN4	708 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	WDCP	Q9H6R7	721 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454		B5MCH6	92 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	GPR42	O15529	346 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PLAT	P00750	562 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PHKG2	P15735	406 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	CACNB3	P54284	484 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	CLRN1	P58418	232 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	DACT2	Q5SW24	774 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	D2HGDH	Q8N465	521 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	MB21D1	Q8N884	522 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TARBP1-208	ENST00000484454	PMM1	Q92871	262 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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