RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484388.1

ABCA4-206, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 4, human

TSL 2

Gene ABCA4, Length 327 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA4-206	ENST00000484388	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MATN2	O00339	956 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	WNT10B	O00744	389 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NOBOX	O60393	691 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MYL3	P08590	195 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SETSIP	P0DME0	302 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NPR1	P16066	1061 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ALDH1A3	P47895	512 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ARFIP2	P53365	341 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NPEPPS	P55786	919 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PTH1R	Q03431	593 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	BTK	Q06187	659 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RIN1	Q13671	783 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CNGA2	Q16280	664 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RNF151	Q2KHN1	245 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	BORA	Q6PGQ7	559 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MDM1	Q8TC05	714 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	STON2	Q8WXE9	905 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CEP95	Q96GE4	821 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SGCZ	Q96LD1	299 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CCDC138	Q96M89	665 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NELFA	Q9H3P2	528 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RLIM	Q9NVW2	624 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PADI4	Q9UM07	663 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MED16	Q9Y2X0	877 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ZMYM3	Q14202	1370 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	USP19	O94966	1318 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	UBE2QL1	A1L167	161 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388		B5MCH6	92 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	GRM6	O15303	877 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	B4GALT3	O60512	393 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SLC43A1	O75387	559 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SASH1	O94885	1247 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	MATN4	O95460	622 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	AMH	P03971	560 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ANXA1	P04083	346 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CD1A	P06126	327 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	KIT	P10721	976 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ATP5J	P18859	108 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SLC7A1	P30825	629 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RAP1GAP	P47736	663 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	KCNC1	P48547	511 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PIK3CG	P48736	1102 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PRIM2	P49643	509 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RAC3	P60763	192 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	FMO1	Q01740	532 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	CREM	Q03060	361 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ZNF543	Q08ER8	600 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	ACAP1	Q15027	740 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SURF1	Q15526	300 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	AFMID	Q63HM1	303 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	OGFOD2	Q6N063	350 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	DOK3	Q7L591	496 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	PDSS2	Q86YH6	399 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	OR2C3	Q8N628	320 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ABCA4-206	ENST00000484388	TBCB	Q99426	244 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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