RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478272.1

TMTC4-208, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-208	ENST00000478272	TGFB1I1	O43294	461 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	FGF18	O76093	207 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	GALT	P07902	379 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	IGFBP4	P22692	258 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	DNAJB1	P25685	340 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ABCD1	P33897	745 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ACOT2	P49753	483 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	WNT7B	P56706	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	DSC1	Q08554	894 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	NAB2	Q15742	525 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	AAK1	Q2M2I8	961 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ACAP3	Q96P50	834 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM206	Q9H813	350 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	MARCH5	Q9NX47	278 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SCN1A	P35498	2009 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	TSC2	P49815	1807 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	NRP1	O14786	923 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CLIC2	O15247	247 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CLTA	P09496	248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	IRS1	P35568	1242 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	OR1G1	P47890	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CYP2J2	P51589	502 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	GUCY2F	P51841	1108 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CAMK1	Q14012	370 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	KCNB1	Q14721	858 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CAMK4	Q16566	473 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ISM2	Q6H9L7	571 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	P2RX5	Q93086	422 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMTC4-208	ENST00000478272	PLXNA3	P51805	1871 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	TTC26	A0AVF1	554 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	LACTBL1	A8MY62	500 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	BIN1	O00499	593 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	RB1	P06400	928 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	TH	P07101	528 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	ADRB2	P07550	413 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	NFIC	P08651	508 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	GART	P22102	1010 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	PSMD2	Q13200	908 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	TUSC3	Q13454	348 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	POF1B	Q8WVV4	589 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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