RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473922.1

SIRT1-205, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

TSL 4

Gene SIRT1, Length 576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-205ENST00000473922 VPS52Q8N1B4 723 aa25.99■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 PPM1EQ8WY54 764 aa25.99■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.99■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 TCF25Q9BQ70 676 aa25.99■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa25.99■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 ADAM28Q9UKQ2 775 aa25.99■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 EFEMP2O95967 443 aa25.98■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 CYP3A5P20815 502 aa25.98■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.98■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.98■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.97■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 C12orf56Q8IXR9 622 aa25.97■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 GPD1LQ8N335 351 aa25.97■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.97■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 CLCNKBP51801 687 aa25.96■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.96■■□□□ 1.75
SIRT1-205ENST00000473922 CACNG4Q9UBN1 327 aa25.96■■□□□ 1.75
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SIRT1-205ENST00000473922 FUT10Q6P4F1 479 aa25.95■■□□□ 1.74
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SIRT1-205ENST00000473922 ZNF233A6NK53 670 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 CLIC2O15247 247 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 B3GAT3O94766 335 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 CSPG5O95196 566 aa25.94■■□□□ 1.74
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SIRT1-205ENST00000473922 CXCL14O95715 111 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 SPAG1Q07617 926 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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SIRT1-205ENST00000473922 XXYLT1Q8NBI6 393 aa25.94■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 GPR62Q9BZJ7 368 aa25.94■■□□□ 1.74
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SIRT1-205ENST00000473922 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.748e-7■■■■■ 53.5
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SIRT1-205ENST00000473922 TMEM132DQ14C87 1099 aa25.93■■□□□ 1.74
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SIRT1-205ENST00000473922 GPR65Q8IYL9 337 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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SIRT1-205ENST00000473922 CHST7Q9NS84 486 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 REV3LO60673 3130 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 C2orf71A6NGG8 1288 aa25.92■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 HIDE1A8MVS5 230 aa25.92■■□□□ 1.74
SIRT1-205ENST00000473922 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.92■■□□□ 1.74
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