RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, human

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC13A3-208	ENST00000464518	KIF4A	O95239	1232 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	LYPLA2	O95372	231 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	TH	P07101	528 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	RHO	P08100	348 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	LIMK1	P53667	647 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SHC2	P98077	582 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CAPS	Q13938	189 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	IRF7	Q92985	503 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PARP2	Q9UGN5	583 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	COL4A2	P08572	1712 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	NPTXR	O95502	500 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	FGFR3	P22607	806 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARL2	P36404	184 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	NPY5R	Q15761	445 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	NOTCH4	Q99466	2003 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PTGES	O14684	152 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF197	O14709	1029 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PTPN2	P17706	415 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	OR1D2	P34982	312 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	DMWD	Q09019	674 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	NAB2	Q15742	525 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	INF2	Q27J81	1249 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	N4BP3	O15049	544 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ADAM12	O43184	909 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	GLRA2	P23416	452 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	FCAR	P24071	287 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PSMA5	P28066	241 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PML	P29590	882 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	FAM3C	Q92520	227 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	HAS1	Q92839	578 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	UROC1	Q96N76	676 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	KLK14	Q9P0G3	267 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SLC13A3-208	ENST00000464518	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	ACACB	O00763	2458 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	B4GALT5	O43286	388 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	RECQL4	O94761	1208 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	SLITRK3	O94933	977 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	LRG1	P02750	347 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	PSMC3	P17980	439 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	HOXA6	P31267	233 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SLC13A3-208	ENST00000464518	CXCL12	P48061	93 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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