RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 STYK1Q6J9G0 422 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 COPS6Q7L5N1 327 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-209ENST00000442510 TNFAIP2Q03169 654 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MOGSQ13724 837 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HIC1Q14526 733 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 INSCQ1MX18 579 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.88□□□□□ -1.47
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