RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYTH2	Q99418	400 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP1	O94782	785 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTGIR	P43119	386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTK2	Q05397	1052 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFIX	Q14938	502 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC15A2	Q16348	729 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL4A1	P02462	1669 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A8MXQ7	604 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZWINT	O95229	277 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WTAP	Q15007	396 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADRM1	Q16186	407 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASP10	Q92851	521 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NDE1	Q9NXR1	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.11	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NID2	Q14112	1375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POTEF	A5A3E0	1075 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MATN2	O00339	956 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CIAO1	O76071	339 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POTEI	P0CG38	1075 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT13	P13646	458 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VCL	P18206	1134 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADORA1	P30542	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC5A2	P31639	672 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PFKP	Q01813	784 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LPIN1	Q14693	890 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NADK2	Q4G0N4	442 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAPH1	Q70E73	1250 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLG1	Q12959	904 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NSL1	Q96IY1	281 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM9	Q9C026	710 aa		11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAF1	P21675	1872 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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